支票存根的处理应当遵循以下步骤和注意事项：
支票存根是出票后留下的底子，应与支票内容一致，用于留存备查。因此，必须妥善保管，防止丢失或损坏。
在做凭证时，支票存根应作为附件一同处理。具体来说，开出现金支票时，只需存根作为附件；而开出转账支票时，则需要连同发票等付款凭据和支票存根一起做凭证附件。
如果支票作废，存根也应与作废支票一起保管好。在重新购买支票时，这些作废的存根也需要一并作废。
填写支票存根时，应确保信息准确完整，包括日期、支票号码、收款方名称、金额、用途等关键内容。填写应清晰准确，避免遗漏或错误。
在签发支票后，应立即在存根上完整记录相关信息，以便后续查阅和核对。
可以按照时间顺序、收款方或支付用途等方式对支票存根进行分类，方便查找和统计。
支票存根应存放在安全、干燥、防火防潮的地方，确保其完整性和准确性。
定期对保存的支票存根进行检查和核对，确保其完整性和准确性。如发现存根有缺失或错误，应及时采取措施进行补救和纠正。
如果支票存根丢失，应由银行出具证明或单位写说明，详细写明被遗失支票的号码、用途、支付日期、金额、经办人等。如有条件，最好将此支票存根对应的支票原件复印后作附件，银行对账单及其复印件也同时作附件，以反映出该支票确实已正常使用。
通过以上步骤和注意事项，可以确保支票存根得到规范处理，保障财务记录的准确性和安全性。
