当夫妻离婚且有两个孩子时，法院的判决主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定。以下是可能的判决结果及考虑因素：
如果夫妻双方能够就孩子的抚养问题达成一致意见，法院会尊重双方的意愿，按照双方协商的结果出具判决书。
如果双方不能就孩子的抚养问题达成一致，法院通常会按照“一人抚养一个孩子”的原则进行判决。
在判决时，法院会综合考虑以下因素：
孩子的年龄：两周岁以下的子女一般随母亲生活，但具体情况可能会根据母亲的健康状况和其他因素进行调整。
孩子的性别：虽然性别不应该是决定性的因素，但法院在判决时会考虑。
父母的抚养能力：包括经济条件、生活环境、教育水平等。
孩子的意愿：对于八周岁以上的子女，法院会尊重他们的真实意愿。
其他特殊情况：例如，如果一方有严重疾病或其他不利于孩子成长的情况，孩子可能会判给另一方。
具体案例说明：
假设有一对夫妻离婚，他们有两个孩子，一个五岁，一个十岁。如果双方都不能就抚养问题达成一致，法院可能会判决如下：
爸爸抚养五岁的孩子，因为五岁的孩子跟爸爸生活的时间更长，改变生活环境可能对他不利。
妈妈抚养十岁的孩子，因为十岁的孩子已经比较成熟，法院会尊重孩子的真实意愿。
建议：
父母在离婚时，应尽量通过协商达成一致，以减少对孩子的伤害。
如果协商无果，应准备好相关证据，如经济状况、居住环境、孩子的意愿等，以便在法庭上争取到最有利于孩子的抚养权。
法律咨询和专业律师的帮助在离婚案件中非常重要，可以更有效地维护自己的权益。
